科研好帮手 专业生产商

本公司产品仅供科研使用

18225607483

购物车

0

产品中心Cell Resources

联系我们CONTACT US

  • 微卫星标记STR/SSR

微卫星标记STR/SSR

货号:XYX-1012

规格:样本

价格: ¥ 0.00

  • 微卫星标记STR/SSR
产品详情

微卫星标记STR/SSR

背景介绍

微卫星标记(Microsatellite)也称为短串联重复序列(STR)或简单重复序列(SSR),是广泛分布在真核生物基因组中的简单重复序列。微卫星位点通常通过PCR扩增和电泳检测,并根据片段大小分离等位基因进行分析;扩增后的等位微卫星可以用多种方法检测,传统方法采用聚丙烯酰胺凝胶电泳加放射显影或银染的方法,费时费力效率低。阅微基因基于5年的经验,利用ABI遗传分析仪对荧光标记的DNA片段进行检测,结合分子量内标进行DNA片段长度计算,使STR分型变得高效快捷,结果也更加精确。

服务项目

1.SSR引物开发
通过富集微卫星序列,开发出20-30条具有一定重复特征的微卫星序列,并且对序列进行多态性和特异性验证。

服务编号

方法

内容说明

价格

周期

STR01

SSR引物开发

开发未知基因组序列物种的引物

询价

2-4

STR02

SSR引物筛选

筛选适合荧光检测的引物

询价

2-4

STR03

引物设计与合成

荧光标记引物

询价

1

STR04

PCR条件优化

单重和多重PCR

询价

1-2

STR05

PCR扩增

荧光或非荧光

询价

1-4

STR06

测序仪检测

用测序仪对单色或多色荧光标记DNA 片段进行分离和检测

询价

2-7工作日

STR07

原始数据分析

将原始数据分析为基因型

询价

1工作日-2

STR08

群体遗传学分析

关联分析、连锁图构建等

询价

1-2

STR09

AFLP检测

检测和数据分析

询价

2-5工作日

. 引物筛选
选取部分代表性样本,利用普通引物进行PCR扩增,然后利用高分辨率芯片电泳或PAGE验证引物的特异性、扩增效率和基因座多态性等信息(图1)。


1. 用岛津MultiNA芯片电泳仪进行引物筛选的结果

3.样本批量扩增
用带有荧光标记(FAMHEXTMRROX等)的引物,对批量样本进行PCR扩增。我公司拥有高通量PCR仪平台,可以满足大量样本扩增需求。
4.测序仪检测
带有荧光标记的PCR产物进行稀释后与分子量内标混合,用3730xl等测序仪进行毛细管电泳,并得到原始数据(fsa文件,见图2)。


2. 应用3730xl测序仪检测得到的原始图谱

5.原始数据分析
编制panelbin等文件,使用正版GeneMapper v4.0软件分析测序仪得到的fsa文件,并生成PDF图谱和Excel文档(包括size、基因分型等信息),分析后的电泳图谱见图3


3. GeneMapper软件分析后的电泳图谱

6.群体遗传学分析
利用生物信息学软件(POPGENEMEGAPHYLIPARLEQUIN等)对上述数据进行进一步分析,绘制遗传连锁图谱、分析连锁不平衡和分析多态性等。

送样要求

细胞(106)、组织(≥300mg)、血液(≥1mL)、基因组DNA(≥20μl,浓度≥50ng/μl);引物信息、片段长度范围、琼脂糖电泳图等。

提供结果

引物、微卫星分析的原始数据以及GeneMapper生成的PDF图谱、包含片段长度等信息的Excel文档和进一步的分析结果等。

成功案例

到目前为止,我公司与上百家科研机构建立合作,进行过多个物种的引物开发、多态性分析、种系鉴定和连锁图谱构建等工作,包括人、小鼠、大鼠、兔、马、犬、牛、大熊猫、鱼、虾、麻雀、蜜蜂、蚊子、蚜虫、瓢虫、小麦、玉米、大豆、棉花、杨树、苹果、葡萄和真菌等。
实验流程及案例展示